خطوات الاستخدام
أدخل تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين باستخدام الرموز المكونة من حرف واحد (مثل A للألانين، C للسيستين، D للأسبارتات، إلخ). تأكد من أن التسلسل مكتوب بالأحرف الكبيرة أو الصغيرة، لكن يفضل استخدام الأحرف الكبيرة لتجنب الأخطاء. سيتم تحليل كل رمز إلى الوزن الجزيئي المقابل له من الأحماض الأمينية القياسية.
عند إدخال التسلسل، تقوم الحاسبة بجمع الأوزان الجزيئية المتوسطة لكل حمض أميني فردي. لكل حمض أميني وزن جزيئي متوسط (يعتمد على الوفرة الطبيعية للنظائر). على سبيل المثال، الألانين (A) له وزن جزيئي متوسط 89.09 دا، والجليسين (G) 75.07 دا. تُطرح بعد ذلك كتلة جزيء ماء (H2O، 18.015 دا) عن كل رابطة ببتيدية تتشكل بين الأحماض الأمينية. عدد روابط الببتيد يساوي (عدد الأحماض الأمينية - 1). لذا، الصيغة الأساسية هي: الوزن الجزيئي = (مجموع أوزان الأحماض الأمينية الفردية) - (عدد روابط الببتيد × 18.015).
تقوم الحاسبة أيضًا بحساب الوزن الجزيئي الأحادي النظير (monoisotopic) إذا توفرت البيانات. الوزن الأحادي النظير يستخدم الكتلة الدقيقة لأكثر النظائر وفرة لكل عنصر، وهو أكثر دقة في تطبيقات قياس الطيف الكتلي. بالنسبة للبروتينات الكبيرة، يصبح الفرق بين الوزن المتوسط والأحادي النظير طفيفًا نسبيًا لكنه مهم في التحليلات الدقيقة.