خطوات الاستخدام
أدخل تسلسل الحمض النووي (DNA) في حقل الإدخال. يمكن أن يكون التسلسل مكونًا من الأحرف A، T، C، G فقط (أو a، t، c، g). على سبيل المثال: 'ATGCGATCGA'. تأكد من عدم وجود مسافات أو أحرف غير صالحة.
سيقوم النظام تلقائيًا بحساب عدد النيوكليوتيدات من نوع C (سايتوسين) و G (جوانين) في التسلسل. يتم احتساب كل تكرار لهذه الأحرف بشكل مستقل. يتم تجاهل أي أحرف غير صالحة أو مسافات، ولكن يفضل إزالتها للحصول على نتائج دقيقة.
بعد حساب عدد C وG، يتم حساب إجمالي عدد النيوكليوتيدات في التسلسل (أي جميع الأحرف الصالحة: A، T، C، G). ثم تستخدم الصيغة التالية: (عدد C + عدد G) / (إجمالي عدد النيوكليوتيدات) * 100%.
النتيجة هي النسبة المئوية لمحتوى GC، والتي تتراوح بين 0% (إذا لم يكن هناك أي C أو G) و100% (إذا كان التسلسل مكونًا فقط من C وG). يُظهر الحاسبة النتيجة بدقة تصل إلى منزلتين عشريتين.
يمكن استخدام هذه النسبة في تطبيقات متعددة مثل تقدير درجة حرارة انصهار الحمض النووي (Tm)، حيث أن محتوى GC الأعلى يعني روابط هيدروجينية أقوى (ثلاث روابط بين G-C مقارنة برابطتين بين A-T)، وبالتالي درجة حرارة انصهار أعلى.
أمثلة محلولة
تطبيقات عملية على محتوى GC في DNA بخطوات الحل كاملة.
الحل
أولاً، نحسب عدد النيوكليوتيدات: التسلسل هو ATGCGTACG. يتكون من 9 نيوكليوتيدات. عدد C: يظهر C في الموضع الثالث (C) والموضع السابع (C) ← 2. عدد G: يظهر G في الموضع الرابع (G) والموضع السادس (G) والموضع التاسع (G) ← 3. إذن مجموع C+G = 5. إجمالي النيوكليوتيدات = 9. النسبة = (5/9)*100% = 55.56%. إذن محتوى GC هو 55.56%.
الحل
نقوم بعد عدد C وG في التسلسل: التسلسل: A A T T C C G G A T C G A A T T C G A T C G A T C G. لنعد: C: يظهر في المواضع 5،6،11،17،22 ← 5 مرات. G: يظهر في المواضع 7،8،12،18،23،24 ← 6 مرات. المجموع = 5+6 = 11. إجمالي النيوكليوتيدات = 24. النسبة = 11/24 * 100% = 45.8333%، أي حوالي 45.83%. يمكن للحاسبة إعطاء 45.83%.
أمثلة محسوبة
قيم مُدخَلة ونتيجة محسوبة فعليًا بواسطة محتوى GC في DNA.
قيم مُدخَلة قياسية
- تسلسل DNA
- ATGCATGCAT
قيم مُدخَلة قياسية
- تسلسل DNA
- ATGCATGCATGCATGC