نسبة Ka/Ks

أدخل قيمة Ka (معدل التبديل غير المتآلف): تمثل Ka عدد التبديلات النووية (غير المترادفة) لكل موقع غير مترادف لكل وحدة زمنية. تُحسب هذه القيمة عن طريق مقارنة تسلسلات جينية من أنواع مختلفة وتحديد عدد التغييرات التي تغير الحمض الأميني. يجب أن تكون القيمة موجبة وعادة ما تكون صغيرة (أقل من 1).

أدخل قيمة Ks (معدل التبديل المتآلف): تمثل Ks عدد التبديلات الصامتة (المترادفة) لكل موقع مترادف لكل وحدة زمنية. لا تغير هذه التبديلات الحمض الأميني. تعتبر Ks مقياسًا للمعدل الأساسي للطفرات المحايدة. يجب أن تكون موجبة.

احسب النسبة Ka/Ks: تقسم قيمة Ka على قيمة Ks. إذا كانت النسبة > 1، فهذا يشير إلى انتقاء إيجابي (تغيرات مفيدة يتم تثبيتها). إذا كانت النسبة = 1، فهذا يعني تطورًا محايدًا. إذا كانت النسبة < 1، فهذا يشير إلى انتقاء سلبي (تغيرات ضارة يتم إزالتها).

فسر النتيجة: استخدم النسبة لفهم القوى التطورية المؤثرة على الجين. نسبة عالية تشير إلى أن الجين تطور تحت ضغط انتقائي إيجابي، بينما نسبة منخفضة تشير إلى حفظ وظيفي. تأكد من أن قيم Ka و Ks محسوبة بشكل صحيح باستخدام طرق إحصائية مناسبة (مثل طريقة نيي-جوبوري).