الوزن الجزيئي للبروتين

لحساب الوزن الجزيئي، نحتاج أولاً إلى الأوزان الجزيئية المتوسطة لكل حمض أميني (قيم تقريبية): A: 89.10 Da, C: 121.16 Da, D: 133.10 Da, E: 147.13 Da, F: 165.19 Da. نجمعها: 89.10 + 121.16 = 210.26; +133.10 = 343.36; +147.13 = 490.49; +165.19 = 655.68 Da. هذا مجموع الأحماض الأمينية غير المرتبطة. الآن، عدد روابط الببتيد = 5 - 1 = 4. نطرح وزن جزيئات الماء: 4 × 18.015 = 72.06 Da. إذن الوزن الجزيئي للببتيد = 655.68 - 72.06 = 583.62 Da. يمكن تقريب النتيجة إلى 583.6 Da أو 0.5836 kDa.

الأوزان المتوسطة: M: 149.21, Y: 181.19, S: 105.09, K: 146.19, L: 131.18, M: 149.21 (اجمع: 149.21+181.19=330.40; +105.09=435.49; +146.19=581.68; +131.18=712.86; +149.21=862.07 Da). عدد الروابط: 6-1=5; طرح الماء: 5×18.015=90.075; الوزن المتوسط = 862.07-90.075=771.995 Da ≈ 772.0 Da. الآن الوزن الأحادي النظير: نستخدم كتل النظائر الأكثر وفرة: H=1.007825, C=12.000000, N=14.003074, O=15.994915, S=31.972071. لكل حمض أميني نحسب الصيغة الجزيئية. M: C5H11NO2S (صيغة الأحماض الأمينية الحرة) لكننا نخصم H2O لكل رابطة. للتبسيط، نحسب مجموع كتل الذرات في الببتيد مباشرة. عدد الذرات: C: 6×2 + 5? أفضل طريقة: استخدم قائمة الأوزان الأحادية النظير لكل حمض أميني (معروفة): M: 149.051, Y: 163.063, S: 105.043, K: 128.095, L: 113.084, M: 149.051. نجمع: 149.051+163.063=312.114; +105.043=417.157; +128.095=545.252; +113.084=658.336; +149.051=807.387 Da. الآن نطرح 5×18.010565 (وزن H2O الأحادي النظير 18.010565) = 807.387 - 90.053 = 717.334 Da. الفرق بين المتوسط والأحادي النظير حوالي 54.66 Da لكل 6 أحماض أمينية، وهو كبير نسبيًا بسبب وجود الكبريت والميثيونين. في البروتينات الأكبر، يكون الفرق بالنسب المئوية أقل. يوضح هذا أهمية استخدام النوع الصحيح من الوزن في تطبيقات مطياف الكتلة.