مقدر عدد الكونتيغات

أدخل حجم الجينوم بوحدات زوج القواعد (bp) أو بالميغاباز (Mb) مثل 3×10^9 bp للجينوم البشري. يمثل حجم الجينوم المادة الوراثية الكاملة للكائن الحي، ويؤثر مباشرة على عدد الكونتيغات المتوقعة: كلما زاد الحجم، زاد العدد التقريبي بافتراض طول كونتيغ ثابت.

أدخل طول الكونتيغ المستهدف (Target Contig Length) بوحدات bp أو Kb، وهو متوسط الطول المطلوب للقطع المتصلة في التجميع. يتم تحديد هذا الطول بناءً على أهداف البحث: مثلاً 50000 bp لتحليل الجينات أو 100000 bp للتجميع عالي الجودة. القيم الأكبر تعني عدداً أقل من الكونتيغات.

سيتم حساب العدد التقريبي للكونتيغات باستخدام المعادلة البسيطة: عدد الكونتيغات = حجم الجينوم / طول الكونتيغ المستهدف. هذا التقدير يفترض توزيعاً مثالياً دون فواصل أو تكرارات، لذا يكون تقريبياً.