خطوات الاستخدام
الخطوة الأولى: فهم مفهوم الخريطة الجينية. الخريطة الجينية هي تمثيل خطي لترتيب المواقع الوراثية (المعالم) على الكروموسوم، حيث تُقاس المسافات بينها بوحدات تسمى السنتيمورغان (cM). تعكس هذه المسافات احتمال حدوث عبور (Crossing Over) أثناء الانقسام الاختزالي، وكلما زادت المسافة، زاد احتمال الفصل الجيني. في علم الوراثة، تُستخدم الخرائط الجينية لتحديد مواقع الجينات المسببة للأمراض، وفهم إعادة التركيب، وتصميم دراسات الارتباط.
الخطوة الثانية: تحديد عدد المعالم (Markers). المعالم هي مواقع معروفة على الكروموسوم ذات تباين وراثي (مثل تعدد أشكال طول القطع المقيدة RFLP أو تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة SNP). لحساب طول الخريطة، تحتاج أولاً إلى عدد المعالم (numMarkers) المستخدمة. كلما زاد عدد المعالم، زادت دقة الخريطة، لكنها تتطلب تجارب أكثر تكلفة. على سبيل المثال، إذا كان لديك 10 معالم على كروموسوم واحد، يجب معرفة المسافات بين كل زوج من المعالم المتجاورة.
الخطوة الثالثة: حساب متوسط المسافة بين المعالم (avgDistance). متوسط المسافة هو قيمة متوسطة للمسافات بين كل زوج من المعالم المتجاورة، مقاسة بالسنتيمورغان. يمكن الحصول عليه من بيانات الوراثة السكانية أو من خرائط سابقة. مثال: إذا كانت المسافات بين 3 معالم هي 10 cM و 15 cM، فإن المتوسط هو (10+15)/2 = 12.5 cM.