خطوات الاستخدام
الخطوة الأولى: فهم مفهوم BUSCO واختيار مجموعة الجينات المرجعية المناسبة. يعتمد تقييم اكتمال تجميع الجينوم على مقارنة الجينات الموجودة في التجميع مع مجموعة من الجينات أحادية النسخ المحفوظة تطوريًا (BUSCO). يجب تحديد قاعدة البيانات المناسبة للكائن الحي (مثال: حقيقيات النوى، النباتات، الثدييات) حيث تحتوي كل قاعدة على عدد محدد من الجينات المرجعية (مثلاً 255 جينًا لحقيقيات النوى في إصدار odb10).
الخطوة الثانية: تشغيل أداة BUSCO على ملف تجميع الجينوم. تستخدم الأداة خوارزميات تماثل تسلسلي مثل BLAST أو HMMER للبحث عن الجينات المرجعية في التجميع. يجب تثبيت أداة BUSCO محليًا وتنفيذ الأمر المناسب مع تحديد نوع الكائن الحي ومسار ملف الجينوم. سينتج عن التشغيل ملف إخراج يوضح عدد الجينات الكاملة والمجزأة والمفقودة.
الخطوة الثالثة: إدخال القيم في الحاسبة. بعد الحصول على نتائج تشغيل BUSCO، ستحصل على عددين: 'Found' وهو عدد الجينات المرجعية التي تم العثور عليها بشكل كامل (أو كامل وجزئي حسب التقرير) و 'Total' وهو إجمالي عدد الجينات المرجعية في المجموعة المختارة. أدخل هذين الرقمين في الحاسبة لحساب نسبة الاكتمال.