خطوات الاستخدام
الخطوة 1: أدخل الطول الكلي للتجميع (totalLength): وهو مجموع أطوال جميع الكونتيغات بالقواعد النيتروجينية، ويمثل حجم الجينوم المجمّع التقريبي.
الخطوة 2: أدخل عدد الكونتيغات (contigs): وهو عدد التسلسلات المستمرة الناتجة عن التجميع. تتحقق الحاسبة من اتساق المدخلات فتقارن متوسط الطول المدخل بناتج قسمة الطول الكلي على العدد، وترفض الفرق الأكبر من 25 بالمئة.
الخطوة 3: أدخل متوسط طول الكونتيغ (avgLength): يساوي ناتج القسمة عندما تتساوى الكونتيغات طولا، ويكون عادة أقل منه عندما تكثر القطع القصيرة لأن المتوسط الحسابي تجره الأسفل.
الخطوة 4: طبق النموذج الأسي: إذا توزعت أطوال الكونتيغات توزيعا أسّيا بمتوسط m فإن تغطية الكونتيغات الأطول من x تساوي (1 + x/m)·e^(-x/m)، بمساواتها بـ 0.5 نحصل على N50 ≈ m × ln(4) ≈ 1.386 × المتوسط، ويُقدَّر L50 بربع عدد الكونتيغات.