خطوات الاستخدام
أدخل عدد النيوكليوتيدات في حقل الإدخال. يمثل هذا العدد طول البادئ (البرايمر) الذي تخطط لاستخدامه في تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR). يتراوح الطول الأمثل بين 18 و24 نيوكليوتيداً، وهو ناتج عن توازن دقيق بين الخصوصية وكفاءة الالتصاق. الطول الأقل من 18 قد يسبب التصاقاً غير محدد، بينما الطول الأكبر من 24 يزيد من درجة حرارة الانصهار (Tm) ويصعب التحكم في التفاعل.
بعد إدخال القيمة، انقر على زر 'احسب' أو 'تحقق'. ستقوم الحاسبة بمقارنة الطول المُدخل بالنطاق المثالي. إذا كان الطول ضمن 18-24، سيعرض رسالة تشير إلى أن البادئ مثالي. إذا كان أقل، فسينصحك بزيادة الطول، وإذا كان أكبر، فسينصحك بتقصيره. يعتمد هذا التحليل على المبادئ الأساسية لتصميم البادئات في البيولوجيا الجزيئية.
افهم العلاقة بين طول البادئ ودرجة حرارة الانصهار (Tm). كلما زاد الطول، زادت Tm بمقدار 2-4 درجات مئوية لكل نيوكليوتيد إضافي، وذلك حسب تركيب القواعد. Tm المثالية لمعظم تفاعلات PCR تتراوح بين 50-60 درجة مئوية. استخدام هذه الحاسبة يساعدك على تجنب الأخطاء الشائعة قبل شراء البادئات أو بدء التجربة.