خطوات الاستخدام
أدخل عدد الاستبدالات الثابتة المرصودة (عدد التغيرات النووية أو البروتينية المثبتة التي ظهرت في التسلسل خلال فترة الدراسة)، ويُستخرج عادةً من مقارنة تسلسلات متجانسة بين نوعين أو داخل النوع عبر الزمن. يجب أن يكون عددا صحيحا غير سالب.
أدخل عدد المواقع المفحوصة (إجمالي طول التسلسل من النيوكليوتيدات أو الأحماض الأمينية، مثل 300 موقع). وهو مقام جزئي يضبط الكثافة، فكلما زاد عدد المواقع على القدر نفسه من الاستبدالات قل المعدل الناتج.
أدخل زمن التباعد بوحدة مليون سنة (Myr)، لا بالسنوات الخام؛ فإذا تباعد نوعان منذ 6 ملايين سنة تُدخل العدد 6 وليس 6,000,000. الخلط بين الوحدتين يغيّر الناتج بمقدار مليون ضعف.
تقسم الحاسبة عدد الاستبدالات على (عدد المواقع × الزمن) فيكون الناتج بعدد الاستبدالات لكل موقع لكل مليون سنة، وتعرض في التفاصيل المكافئ لكل مليار سنة (القيمة × 1000) والتباعد التراكمي (الاستبدالات ÷ المواقع)، ثم تصنّف سرعة التطور – مرتفع عندما k ≥ 0.01، ومتوسط عندما تكون 0.001 ≤ k < 0.01، ومنخفض (منطقة محفوظة) أقل من ذلك.